JCLA:快速鉴定不动杆菌属细菌的方法
日期:2017-06-09
近日,国际杂志JournalofClinicalLaboratoryAnalysis上在线发表一项关于基于gyrB基因的PCR检测方法快速鉴定鲍曼不动杆菌-醋酸钙不动杆菌的研究。
目前,不动杆菌属有50多种,其中四种亲缘关系很近,采用表型或基因型方法难以区分,如不动杆菌-醋酸鲍曼不动杆菌复合体(ABC)。在流行病学方面,对不动杆菌属在种水平的正确识别是非常必要的。
本研究评估了利用gyrB基因的多重PCR以ITS16S-23S片段的测序作为金标准来鉴定ABC的种类。研究纳入了2011年巴西南部三家医院鉴定为为醋酸鲍曼不动杆菌的分离株。
研究共获得了117份分离株,通过PCR检测gyrB基因,其中106份(90.6%)经确认为鲍曼不动杆菌,6份(5.1%)为A.nosocomialis,4份(3.4%)为A.pittii。只有一个分离株没有显示gyrB基因的PCR产物;通过ITS的测序将该分离株鉴定为A.genospecie。
同时,研究人员还能从呼吸道(8/72.7%),血液(2/18.2%)和尿(1/9.1%)中得到非鲍曼不动杆菌分离物,表明这些种类可引起严重感染。
这些发现证明,gyrB的多重PCR是识别种级别的分离株的可行其简便的方法。